Vozač Dukatija, Francesco Bagnaia, postavio je još jedan rekord kruga na Misanu, osvojivši svoju drugu pol poziciju u MotoGP šampionatu na ovoj stazi u razmaku od samo dvije sedmice, ispred rivala u šampionatu, Jorgea Martina. Bagnaijin završni krug od 1:30.031 bio je dovoljan da preuzme pol poziciju od Martinovog timskog kolege iz Pramak tima, koji je takođe postavio novi rekord kruga ranije u sesiji.
Marco Bezzecchi zauzeo je šesto mjesto u drugom redu, dok će ispred njega startovati Marc Márquez iz Gresinija, koji je pao nakon što je postavio svoj prvi krug i nije mogao da poboljša vrijeme. Maverick Viñales startovaće s osmog mesta, ispred bivšeg timskog kolege Fabija Quartarara na Yamahi, dok je Franko Morbidelli zauzeo deseto mjesto.
Aleix Espargaro iz Aprilije kvalifikovao se na 11. mjestu, ispred Miguela Oliveire, pri čemu su obojica vozača završila Q2 s vremenima koja su bila sekundu sporija od Bagnaijinog pol vremena. Fabio Di Giannantonio iz VR46 tima jedva je propustio Q2 uprkos povredi i startovaće s 13. mesta, ispred Raula Fernandeza iz Trackhousea.
Luca Marini predvodi par Repsol Honde i startovaće obje trke s 15. mesta, ispred Joana Mira na 16. poziciji. Johann Zarco startovaće s 17. mjesta, ispred Augusta Fernandeza, koji je pao dok je pokušavao poboljšati svoje vreme u Q1. Jack Miller je imao noćnu moru tokom kvalifikacija, završivši na 19. mjestu i zauzeće predposlednji red startne linije, gde će mu se pridružiti Takaaki Nakagami i Alex Marquez, koji je pao na prvom zavoju nakon svog prvog bržeg kruga.
Iako je učestvovao u posljednjem treningu, Alex Rins nije nastupio u kvalifikacijama i ukoliko se odluči nastaviti vikend, startovaće poslednji na gridu.